microbiomeViz

Let’s try this for fun!

微生物种名属名经常需要*斜体*表示，现在microbiomeViz添加了一个生成expression的函数，可以直接将一个短语中的一个（个人认为很少会遇到画图时axis label涉及多个物种）指定名字变成斜体。

平日经常会分析shotgun宏基因组的数据，我们的pipeline使用MetaPhlAn，Kraken等profiler。一直觉得GraPhlAn的图很好看，在Y叔的指导下准备基于ggtree来用R实现它。